الگوریتم ها و روش ها در بیوانفورماتیک ساختاری (زیست شناسی محاسباتی)
ساختار سه بعدی و عملکرد مولکول ها چالش ها و فرصت های زیادی را برای توسعه درک سیستم های بیولوژیکی ایجاد می کند. با افزایش در دسترس بودن ساختارهای مولکولی و دقت پیش‌بینی‌های ساختاری و شبیه‌سازی‌های مولکولی، فضا برای پیشرفت الگوریتمی در بسیاری از مسائل تحلیلی و پیش‌بینی گسترده و عمیق است. برای حمایت از این زمینه، مجموعه‌ای غنی از روش‌ها و الگوریتم‌ها در دسترس هستند که به مشکلات مهم مختلفی مانند برهمکنش‌های پروتئین-پروتئین، تأثیر جهش‌ها بر ساختار و عملکرد پروتئین و تعیین ساختار پروتئین پرداخته است. علیرغم پیشرفت های اخیر در این زمینه، به ویژه در تاکردن پروتئین با توسعه AlphaFold، بسیاری از مشکلات هنوز حل نشده باقی مانده اند.
در این کتاب ما بر روی تعدادی از موضوعات در بیوانفورماتیک ساختاری تمرکز می‌کنیم: تشخیص ساختاری Cryo-EM، اکتشاف ساختاری پروتئین، توضیح سطح اتصال مولکولی با استفاده از هندسه، تأثیر جهش‌ها، درج‌ها و حذف‌ها بر پایداری ساختاری پروتئین، و اتصال پروتئین به لیگاند. .
Algorithms and Methods in Structural Bioinformatics (Computational Biology)
The three-dimensional structure and function of molecules present many challenges and opportunities for developing an understanding of biological systems. With the increasing availability of molecular structures and the advancing accuracy of structure predictions and molecular simulations, the space for algorithmic advancement on many analytical and predictive problems is both broad and deep. To support this field, a rich set of methods and algorithms are available, addressing a variety of important problems such as protein-protein interactions, the effect of mutations on protein structure and function, and protein structure determination. Despite recent advancements in the field, in particular in protein folding with the development of AlphaFold, many problems still remain unsolved.
In this book we focus on a number of topics in Structural Bioinformatics: Cryo-EM structural detection, protein conformational exploration, elucidation of molecular binding surface using geometry, the effect of mutations, insertions and deletions on protein structural stability, and protein-ligand binding.
Product details
- ASIN : B0BCV9JJCG
- Publisher : Springer (September 1, 2022)
- Publication date : September 1, 2022
- Language : English
- File size : 12483 KB
- Text-to-Speech : Enabled
- Screen Reader : Supported
- Enhanced typesetting : Enabled
- X-Ray : Not Enabled
- Word Wise : Not Enabled
- Print length : 214 pages